正高级职称人员

基本介绍

董俊超 教授
DNA双链断裂修复机制及基因组不稳定性
博士导师
免疫学/分子生物学/
广州市中山二路74号 中山大学北校区中山医学院
dongjch@mail.sysu.edu.cn

个人简介:

 

 董俊超博士现任中山大学中山医学院教授,博士生导师。2002年于复旦大学生命科学学院获得学士学位;2010年于美国德克萨斯大学圣安东尼奥健康科学中心获得博士学位;2011年起在美国哈佛大学医学院附属波士顿儿童医院从事博士后研究,导师为霍华德休斯医学研究所资深研究员和美国科学院院士、著名免疫学家Frederick Alt教授。2016年获聘第二批中山大学“百人计划”引进人才,并入选第十三批国家“千人计划”青年项目,20172月加入中山大学医学院。
  
主要研究领域和兴趣为DNA双链断裂的修复途径和基因组不稳定性的机制。目前研究工作主要集中在以遗传学方法结合高通量DNA测序研究小鼠B淋巴细胞抗体基因重排、DNA双链断裂修复的机制及相关修复途径缺失而导致的原发性免疫缺陷疾病。已经以(并列)第一或co-senior作者身份发表多篇学术论文,分别刊登在
NaturePNAS、Molecular CellEMBO J.等国际知名杂志。后续研究着眼于进一步研究DNA双链断裂修复途径与B淋巴细胞抗体类别转换的分子机理,并探索在不同组织细胞中DNA双链断裂修复和染色体易位发生的分子机制

 

重要学术研究成果与贡献:

   董俊超博士在不同的模式系统中研究了DNA双链断裂与基因组不稳定性的机制。发生在外周免疫器官生发中心成熟B细胞内的抗体类别转换(class switch recombination, CSR)在不改变抗原抗体反应特异性的前提下,通过改变重链恒定区基因来表达不同类别的抗体,以实现不同下游效应功能。遗传性基因突变引起的类别转换异常会引起原发性抗体缺陷病,患者血清中IgM含量正常或增高而IgGIgAIgE等类型抗体的含量降低,从而引起反复细菌感染、自身免疫性疾病和恶性肿瘤的发病率上升等临床症状。从分子机理上讲,CSR是发生在抗体重链基因的DNA片段重组事件,初始表达IgMB细胞在生发中心遭遇抗原刺激后启动胞嘧啶脱氨酶AID的表达和活化并被募集到转换区诱导双链断裂,激活ATM激酶依赖的DNA损伤应答信号(DNA damage response, DDR)ATM通过进一步磷酸化下游效应分子H2AX53BP1等来扩增损伤信号,以促进非同源末端连接机制(classical non-homologous end-joining, C-NHEJ)进行双链断裂的修复,使得下游目标恒定区基因靠近已经重组的V(D)J可变区,引起相应抗体类型的表达。CSR过程中的DSB修复途径及调控机制仍然不是十分清楚。
   
   董俊超博士开发了基于高通量DNA测序的新方法以研究CSR过程中DNA双链断裂的接合机制,其主要发现如下:(1)激活的正常成熟B细胞高度倾向于以删除而非倒转的方式接合SDNA双链断裂,从而促进高效性的抗体生成;这一过程需要同一染色体上Ig重链基因区的环化构象,且高度依赖DDR蛋白的作用;在DNA损伤检验点蛋白缺失情况下,DNA双链断裂末端失去保护,引起大量的末端降解,进而引起倒转事件的增加,成为导致CSR效率降低的重要原因。该项新技术以高于传统Sanger测序法上千倍的检测效率,提供了传统方法达不到的技术细节,更好地解释了不同DDR因子和修复蛋白在CSR过程中的作用机制。这一工作已经发表在国际学术期刊Nature杂志上并在同一期被综述评论。(Nature 2015 Sep 3;525(7567):134-9) (2)研究了DDR缺失条件下SDNA双链断裂更倾向于以微同源序列(Microhomology, MH)介导的替代末端接合方式进行修复,揭示了不同突变体中SDSB末端降解程度和MH使用之间的正相关性,这一发现纠正了以往采用传统方法的研究得出的错误结论,进一步显示了基于高通量测序的CSR接合检测法在研究DSB双链断裂修复机制中的作用,这一成果已经以co-senior作者发表在PNAS杂志上(Proc Natl Acad Sci USA.2018 Jan 23;115(4):762-767)。(3)以上述高通量测序法详细研究了组蛋白甲基化酶MMSET在调节CSR过程中的作用,结果显示MMSET突变体中CSR接合序列的分布与野生型没有显著差异,且SDSB末端切除和接合序列中MH的使用程度也与野生型高度一致, MMSET突变体中不存在如NHEJ53BP1突变体中的大量未修复的S区双链断裂,表明MMSET并不像53BP1一样参与DSB末端保护和修复途径调控,很有可能在末端接合修复途径中不发挥作用,而是通过甲基化作用
调控AIDS区的募集,进而通过影响SDSB生成而促进CSR。这一成果已经发表在PNAS杂志上(Proc Natl Acad Sci USA.2017 Dec 5;114(49):E10560-E10567).

学术论著与教材:

1.     Panchakshari RA, Zhang X, Kumar V, Du Z, Wei PC, Kao J, Dong J*, Alt FW*. DNA double-strand break response factors influence end-joining features of IgH class switch and general translocation junctions. Proc Natl Acad Sci U S A. 2018 Jan 23;115(4):762-767. (*co-senior author)

2.      Nguyen HV, Dong J, Panchakshari RA, Kumar V, Alt FW, Bories JC. Histone methyltransferase MMSET promotes AID-mediated DNA breaks at the donor switch region during class switch recombination. Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Dec 5;114(49)

3.     Hu J, Meyers RM, Dong J, Panchakshari RA, Alt FW, Frock RL. Detecting DNA double-stranded breaks in mammalian genomes by linear amplification-mediated high-throughput genome-wide translocation sequencing. Nat Protoc. 2016 May;11(5):853-71

4.     Dong J#, Panchakshari RA#, Zhang T#, Zhang Y, Hu J, Volpi SA, Meyers RM, Ho YJ, Du Z, Robbiani DF, Meng F, Gostissa M, Nussenzweig MC, Manis JP, Alt FW. Orientation-specific joining of AID-initiated DNA breaks promotes antibody class switching. Nature. 2015 Sep 3;525(7567):134-9 (#co-first author)

5.     Gostissa M, Schwer B, Chang A, Dong J, Meyers RM, Marecki GT, Choi VW, Chiarle R, Zarrin AA, Alt FW. gH class switching exploits a general property of two DNA breaks to be joined in cis over long chromosomal distances. Proc Natl Acad Sci U S A. 2014 Feb 18;111(7):2644-9

6.     Li F#, Dong J#, Eichmiller R, Holland C, Minca E, Prakash R, Sung P, Shim E, Surtees JA, Eun Lee S. Role of Saw1 in Rad1/Rad10 complex assembly at recombination intermediates in budding yeast. EMBO J. 2013 Feb 6;32(3):461-72 (#co-first author)

7.     Toh GW#, Sugawara N#, Dong J#, Toth R, Lee SE, Haber JE, Rouse J.Mec1/Tel1-dependent phosphorylation of Slx4 stimulates Rad1/Rad10 dependent cleavage of non-homologous DNA tails. DNA Repair (Amst). 2010 Jun 4;9(6):718-2 (#co-first author)

8.     Li F, Dong J#, Pan X, Oum JH, Boeke JD, Lee SE. Microarray- based genetic screen defines SAW1, a gene required for Rad1/Rad10-dependent processing of recombination intermediates. Mol Cell. 2008 May 9;30(3):325-35 (#co-first author)

获奖及荣誉:

2016 入选中山大学第二批“百人计划”
2016 入选中组部第十三批“千人计划”青年项目
2017 入选广东省“珠江人才计划”引进创新创业团队
2017 科技部重点研发项目骨干

 

学术兼职:

为以下学术期刊特邀审稿人:

Cancer Letters (影响因子5.62)
Molecular and Cellular Biology (影响因子4.78)
International Journal of Biological Sciences (3.98)
PLOS One(影响因子3.23)
Mutation Research (影响因子3.68)

其 他:

   本实验室现招收硕士研究生和博士研究生,并长期招聘专职科研人员及科研助理若干,热忱欢迎有志于免疫缺陷疾病、DNA双链断裂修复及基因组不稳定性研究的同学和同行加入。 专职科研人员岗位及相关待遇:
1. 特聘研究员:在海内外知名高校或研究机构取得博士学位,有三项以上学术成果(至少两项中科院一区期刊论文),工资待遇28-35万。
2. 特聘副研究员:博士学位,有两项以上学术成果(中科院二区期刊以上论文),工资待遇18-25万。 
3. 博士后:博士毕业,有至少一项学术成果,工资待遇18-20万。 

注:1)专职科研人员为非独立职位,无教学任务并可申请各类科研项目;
  2专职科研人员合同聘期3年,期满考核优秀者可晋升高一级专职科研职位;
  3)根据专职科研人员的实际能力和工作业绩,课题组发放额外绩效补贴;
  4)博士后在站期间提供博士后公寓,按国家、广东省及我校规定协助解决其子女入学问题;
  5)课题组可为参加面试并获录取的人员报销差旅费。

专职科研人员要求:
1). 热爱科研事业并具有很好的合作精神,能够在课题组负责人的带领下设计实施科研课题,具有扎实的实验操作能力;
2). 免疫学研究背景,熟悉下一代高通量测序,或精通生物信息学分析之一者优先考虑;
3). 具有较好的中英文写作及交流能力。

科研助理要求和待遇:
1. 主要工作职责:协助课题组负责人进行日常运作及财务方面各项事宜,如仪器设备的采购和维护、试剂耗材的订购和管理、协助课题经费申请及管理、财务报销等,并能在实验室负责人的安排下适当参与具体的科研项目;
2. 对有责任心表现积极的科研助理给予有竞争力的薪酬;基本待遇按照中山大学技术员相关标准,课题组按工作表现发放相应的额外补助。
3.要求有很强的责任心,工作积极主动、细心周全;
4.有较好的文字和口头交流能力,能熟练使用网络和常规办公软件(Microsoft Office等)。
5.有一定生物学实验基础或实验室管理经验者优先。

请应聘者将个人简历(含个人基本信息、学习和工作经历、联系方式、参与的科研项目和推荐人联系方式等)、已发表论文全文PDF以及其他能证明本人科研水平的相关资料发送至:dongjch@mail.sysu.edu.cn

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