个人简介

中山大学中山医学院副教授，硕士生导师。2020年博士毕业于中山大学中山医学院，导师丁俊军教授。2020.11-2023.12在中山大学中山医学院开展博士后研究工作，2024.01-2026.01为中山大学中山医学院特聘副研究员。长期聚焦三维基因组调控细胞命运决定与转变的分子机制。主要利用三维基因组组学技术，结合分子生物学、生物化学与基因编辑等手段，在干细胞分化、体细胞重编程等系统中，系统解析三维基因组结构如何精准调控基因表达程序，并探索通过操纵三维基因组结构实现细胞命运定向调控的新策略。

近年来，以第一作者(含共同)在Nature Genetics、Nature Communications、Genome Biology等国际权威期刊发表多项研究成果。主持国家自然科学基金青年项目（C 类）及广东省自然科学基金面上项目等。相关研究工作受到国内外学术界和公众媒体的广泛关注，成果被Protein & Cell, China Life Sciences, Life Medicine 等期刊撰文评述。

重要学术研究成果与贡献

基因组在细胞核中以高度有序的三维结构存在，不同类型细胞具有特异性的三维基因组构象。然而，三维基因组如何被精准折叠、如何调控细胞命运决定及其异常是否导致疾病，仍是生命科学领域的核心问题。围绕这一科学主线，本课题组主要取得了以下系统性成果：

  1.是谁负责精准折叠三维基因组结构？

整合化学标记与基因编辑技术，开发了目前唯一能够系统鉴定特定染色质互作环（chromatin loop）上全部结合蛋白的技术（LoopID），并发现新的三维基因组结构调控因子（Nature Genetics, 2025）。

  2.三维基因组结构如何被折叠？

在机制层面，首次揭示了相分离是介导三维基因组结构调控的新模式，阐明了生物分子凝聚体在染色质高级结构形成中的关键作用（Genome Biology, 2021）。

3.三维基因组结构异常是否导致疾病？

构建早衰症干细胞疾病模型，首次发现三维基因组结构紊乱可引起心血管系统分化障碍，为早衰症相关心血管疾病提供了潜在的分子机制解释（Nature Communications, 2024）。

上述系列工作从技术方法—分子机制—疾病关联三个层面系统推进了三维基因组领域的发展，显著深化了对细胞命运调控本质的理解。

近5年发表的学术论文

（*co-first author，#corresponding author）

  1. Shaoshuai Jiang*, Xinyi Liu*, Zhuheng Zhang*, Mingzhu Yang*, et al. Junjun Ding#. JMJD2 regulates enhancer–promoter interactions via biomolecular condensate formation. Nature Genetics. 2025 Dec 16. doi: 10.1038/s41588-025-02415-8. (IF:37.4).
  2. Wei Jin*, Shaoshuai Jiang*, Xinyi Liu*, Yi He*, et al. Junjun Ding#, Zhongjun Zhou#. Disorganized chromatin hierarchy and stem cell aging in a male patient of atypical laminopathy-based progeria mandibuloacral dysplasia type A. Nature Communications. 2024 Nov 20;15(1):10046. doi: 10.1038/s41467-024-54338-3. (IF:16.6).
  3. Xinyi Liu*, Shaoshuai Jiang*, Lin Ma, Jiale Qu, Longying Zhao, Xing Zhu, Junjun Ding#. Time-dependent effect of 1,6-hexanediol on biomolecular condensates and 3D chromatin organization. Genome Biology. 2021 Aug 17;22(1):230. doi: 10.1186/s13059-021-02455-3. (IF: 17.906).

其它参与论文节选

  1. Jiale Qu*, Jun Sun*, Cai Zhao, Xinyi Liu, Xinyao Zhang, Shaoshuai Jiang, et al, Junjun Ding# (Corresponding author). Simultaneous profiling of chromatin architecture and transcription in single cells. Nature Structural & Molecular Biology. 2023 Sep;30(9):1393-1402. doi: 10.1038/s41594-023-01066-9. (IF:18.36).
  2. Jia Wang, Haopeng Yu, Qian Ma, Pengguihang Zeng, Danya Wu, Yingping Hou, Xinyi Liu, Lumeng Jia, Jun Sun, Yilong Chen, Diana Guallar, Miguel Fidalgo, Jiahao Chen, Yangyinhui Yu, Shaoshuai Jiang, et al, Junjun Ding#. Phase separation of OCT4 controls TAD reorganization to promote cell fate transitions. Cell Stem Cell. 2021 May 25; doi: 10.1016/j.stem.2021.04.023. (IF: 25.269).
  3. Chao Wei*, Lumeng Jia*, Xiaona Huang*, Jin Tan*, Mulan Wang, Jing Niu, Yingping Hou, Jun Sun, Pengguihang Zeng, Jia Wang, Li Qing, Lin Ma, Xinyi Liu, Xiuxiao Tang, Fenjie Li, Shaoshuai Jiang,et al, Junjun Ding#. CTCF organizes inter-A compartment interactions through RYBP-dependent phase separation. Cell Research. 2022 Aug;32(8):744-760. doi: 10.1038/s41422-022-00676-0. (IF:46.297).